2023년 11월 30일 공군 장비도태심의위원회에서 해당 기체의 수리비가 신품 구매비용보다 비싸 결국 도태시키기로 확정되었다.# 하지만 F-35A 추가도입 댓수가 20대로 확정되어 이 기체의 손실분량을 채우지는 못했다.

공군은 도태된 해당 기체를 정비사 훈련 장비로 활용하기로 했으나, 본 기지인 청주 비행장으로 옮길 방법이 마땅치 않아 고심 중인 것으로 알려지고 있다. 가장 무난한 방법은 해당 기체를 분해하여 지상 혹은 공중으로 이동시키는 것이지만 F-35 분해를 미국 측이 반대하고 있다고 한다. 헬기를 통해 동체를 그대로 들어올려 공중 수송하는 방법도 제시되고 있으나, 국군이 보유한 CH-47로는 기체 무게를 감당할 수 없으며 F-35C 동체를 슬링 수송하는 데에 성공한 CH-53K를 미군 측으로부터 협조 받아 동원하는 방법 역시 양자 간 이견이 있는 것으로 알려지고 있다.# 결국 미국의 허락 하에 해체해서 17비로 옮기기로 했다. #

다만 2026년 추가 도입될 F-35A는 청주 비행장이 아닌 타 비행장으로 분산 배치할 방침이며, 분산 배치 대상지로는 현재 도태된 F-35A 기체가 보관되어 있는 서산 비행장도 물망에 올라 있어 서산 비행장에 F-35 추가 도입분이 배치된다면 굳이 무리해서 옮기지 않아도 될 것이라는 전망도 나온다. 그러나 F-35A의 본산이 17비라서 어느 비행단에 F-35A 1개 대대가 추가 배치되든 전력화를 담당한 17비의 도움을 받지 않을 수 없고, 17비에는 F-35A의 정비창도 설치될거라서 불용처분되어 정비용으로 쓰일 F-35A는 제자리를 찾아가는 셈이 된다.

F-35A는 폐기 후 정사사 훈련 장비로 활용하고 있는 것 같다.